ارزیابی پیوستگی نشانگرهای مولکولی est-ssr در بزرک linum usitatissimum l.) )
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده کشاورزی
- نویسنده وحیده سادات رضوی
- استاد راهنما قدرت الله سعیدی اقا فخر میرلوحی محمد مهدی مجیدی
- سال انتشار 1392
چکیده
استفاده در این پژوهش، 42 نشانگر در بین والدین چندشکلی نشان دادند و برای انجام pcr در بین 105 نتاج f2 استفاده شدند. پس از امتیازدهی نوارها، با استفاده از نرم افزار mapmaker/exp ver3.3 با معیار حداکثر فاصله 50 سانتی مورگان و حداقل lod برابر3 ، پنج گروه پیوستگی تشکیل شد.20 نشانگر est-ssr ، چهار صفت فیزیولوژیک و صفت مورفولوژیک رنگ بذر در نقشه قرار گرفتند.درگروه اول، پنج نشانگر est-ssr ، چهار صفت فیزیولوژیک و صفت رنگ بذر قرار گرفت. در گروه دوم و سوم هرکدام دو نشانگر est-ssr و گروه چهارم و پنجم به ترتیب شش و پنج نشانگر est-ssr قرار گرفت. در کل پنج گروه پیوستگی 6/785 سانتی مورگان از نقشه را پوشش داد. کلیه آغازگرهایی که درگروه لینکاژی چهارم قرار گرفتند، در نقشه توافقی تهیه شده توسط کلوتیر و همکاران نیز همگی در گروه لینکاژی هفتم بودند. اغلب نشانگرهایی که در مطالعه حاضر به هیچ گروه پیوستگی تعلق نگرفتند، در نقشه توافقی یا بر روی گروههای پیوستگی متفاوت قرار داشتند و یا در فاصله ایی بیشتر از 50 سانتی مورگان از دیگر نشانگرها بودند، که این امر دلیل اصلی عدم لینکاژ بیش از 40 درصد از نشانگرهای مورد بررسی در این مطالعه بود. تجزیه به مولفه های تعدیل شده (pcoa) پایین(25%) ، تایید کننده پراکندگی و توزیع یکنواخت نشانگرهای مورد استفاده در سطح ژنوم بود. در نهایت نمای کروموزومی گروه های پیوستگی با استفاده از نرم افزار winqtlcart2.5 ترسیم شد.
منابع مشابه
Flax (Linum usitatissimum L
The archaeological evidence of flax cultivation dates back to >6000 BC and it is considered as one of the oldest and most useful crops. Components of flax have diverse uses. Cultivar development of flax is currently focused on enhancing the oil content and nutritional value to meet the demand of nutraceutical market supply, as an alternate source of fish oil, a rich source of eicosapentaenoic a...
متن کاملDevelopment of Novel SSR Markers for Flax (Linum usitatissimum L.) Using Reduced-Representation Genome Sequencing
Flax (Linum usitatissimum L.) is a major fiber and oil yielding crop grown in northeastern China. Identification of flax molecular markers is a key step toward improving flax yield and quality via marker-assisted breeding. Simple sequence repeat (SSR) markers, which are based on genomic structural variation, are considered the most valuable type of genetic marker for this purpose. In this study...
متن کاملGenetic Basis of Variation in Linseed (Linum usitatissimum L.) Cultivars
373 Abstract: This investigation was conducted at the University of wales in 1991-1994. The work described in this paper concerned with the genetic basis of variation in important characters of linseed (Linum usitatissimum L.) A 8x8 full diallel cross including reciprocals was carried out using the cultivars Linda, Lidgate, Cristal, Antares, Barbara, Blue-Chip, Norman and McGregor and eight cha...
متن کاملارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپهای جو با استفاده از نشانگرهای SSR و EST-SSR
تعیین سطح تنوع ژنتیکی و روابط بین ژنوتیپها اساس شناسایی والدین مناسب برای اهداف اصلاحی مختلف بشمار میرود. در این راستا نشانگرهای مولکولی بطور موفقیتآمیز در ارزیابی تنوع ژنتیکی انواع گیاهان زراعی مورد استفاده قرار گرفتهاند. در این آزمایش، تنوع ژنتیکی 35 لاین و رقم جو، با استفاده از 19 جفت آغازگر SSR و EST-SSR بررسی شد که در مجموع 157 آلل چند شکل با میانگین 85/7 آلل به ازای هر جفت آغازگر تکث...
متن کاملEvaluation of Genetic Divergence in Indian Flax (linum Usitatissimum L.)
Flax (Linum usitatissimum L.) belongs to the genus Linum of the family Linaceae commonly known as “Alsi” and has 2n = 30 chromosomes. Linseed is one of the important rabi oilseed crops of India, cultivated in light soil under one or two irrigation in Madhya Pradesh, Chhattisgarh, Uttar Pradesh, Maharashtra, Rajasthan, West Bengal, Karnataka, Orissa and Bihar (Pali and Mehta, 2014). Chhattisgarh...
متن کاملBiotechnology of Flax (Linum usitatissimum)
Biotechnology can offer useful tools to complement conventional breeding programs. The techniques of in vitro selection, that exploit phenomenon, called somaclonal variation, by screening cell cultures for resistance to herbicides, different types of stress or diseases, already helped to obtain tolerant lines of flax (Linum usitatissimum), which were used in further commercial breeding programs...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده کشاورزی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023